Lab notebook을 이용해서 project 관리하자.

2019년 12월 03일 석사생활 3달차,

여러 project를 진행하고 있다. 

1. Uniform diffuser

2. Prussian Blue

3. Combine CW and FDPM into New system using Deep learning

4. Hair Counter

5. Cell Counter

이 있는데 주로 3번을 main research로 잡고 가고 있다.

하면서 느낀점이 이것을 정리해놓을 책이 필요하다고 느꼈다.

 

분명 Word파일로 저장해 놓는것도 좋겠지만,

최근들어 글로 직접쓰면서 정리되는 느낌을 더 받았고 그것이 나에게 맞았다.

 

그래서 이번 기회에 일반적으로 효율적인 Project 진행을 위해 Lab book을 어떻게 쓰고 있는지 

궁금해서 찾아보았다. 그 결과 NIH라고 하는 미국의 보건복지부에서 내놓은 Guide를 정리하고자 한다.

 

 

1. Lab notebook은 무엇인가?

Lab notebook이 무엇인지, 그렇지 않은 것은 무엇이며, 좋은 공책을 유지하는 것이 왜 중요한지 이해할 필요가 있다.  

(1) Lab notebook is...

• 다른 연구자에게 전달할 절차, 시약, 데이터 및 생각의 완전한 기록
  실험실 공책은 다른 과학자가 당신의 관찰을 재현할 수 있도록 하는 절차(수행하는 행위), 사용하는 시약, 당신이 하는 관찰(이것이 데이터), 그리고 관련 사고 과정에 대한 완전한 기록이다. 
• 실험이 시작된 이유, 수행 방법 및 결과
• 부정 행위 혐의로부터 특허를 입증하고 데이터를 보호하는 법적 문서
  당신의 실험실 공책이 법적 문서라는 것을 이해하는 것이 중요하다. 당신의 연구가 특허발급에 기여하는 경우, 그것은 당신의 그룹의 발견에 대한 주장을 문서화하기 때문에 면밀히 조사될 것이다.  
• 과학적 유산
  당신이 실험실에서 옮겨온 지 오래 후에, 당신의 노트는 계속 남아있고 참고될 것이다. 
  다른 사람들은 당신이 지금 하고 있는 연구를 기반으로 할 것이고 그들이 당신이 한 것을 복제할 수 있는 것이 필수적이다. 제대로 된 공책이라면 쫓아오는 사람들이 그렇게 할 수 있을 것이다.

(2) Lab notebook is not

• 일지
  Lab notebook에 대한 일반적인 생각는 그것이 개인적인 생각을 적는 일기라는 것이다.
  특정 실험에 의해 시험될 가설을 기록하는 것 vs 일이 어떻게 돌아가는지에 대한 생각을 적는 것
  에는 차이가 있다. 물론 연구의 방향에 대해 생각하고, 시스템이 어떻게 작용하는지에 대해 이론화하는 것은 좋으나,
  이러한 생각과 아이디어는 실험실 공책에 보관되어서는 안 된다.
• 대화 기록지
  내가 상사나 동료들과 나눈 대화한 것을 보관하면 안된다.
• 프로토콜 저장소
  상용 제품 설명서에서 프로토콜을 복사해서 붙이거나 해선 안된다. 회사와 제품을 문서화하면 절차에서 설명서를 참조할 수 있으므로, 그러므로 참조 주소만 달자.
• 니꺼
  가장 중요한것은 당신의 것이 아니라는 것이다. 그것은 당신이 일하고 있는 기관의 것이다. 어떤 이유로든 그것을 집에 가져가서는 안 된다. 단, 당신은 당신의 모든 작품을 복사할 권리가 있으며 매우 권장되는 사항이다.

2. Lab notebook의 종류와 장단점

(1) 종류

• 바운드/스티치드 노트북
  가장 기본적이고 전통적인 실험실 공책이다. 이것은 페이지마다 번호가 매기지고 묶여져 있어 잃어버릴 가능성도 낮다. 또한 번호가 매겨져있으므로, 어떤 페이지가 제거되었는지 쉽게 알 수 있다. 고로 법적으로 강력하다.
  허나, 이러한 노트는 사본으로 만드는 것이 어렵고 내가 한 일을 순서대로 기록해야 하므로 실험에 의한 공책 정리가 어렵다. 또한 개발, 데이터시트 같은 것을 삽입할 방법이 없으므로 데이터를 다른곳에 보관하고 참고해야한다. 
• 느슨한 잎/3개의 링 바인더 노트북
  위 2가지 단점을 제거할 수 이다. 허나 시트를 분실할 염려가 크기 때문에 데이터 무결성을 해친다.
• 전자수첩
  사용 편의성이 좋다. 또한 데이터를 디지털 파일로 변환하면 쉽게 참조가능하다.
  단, 빈번한 백업이 필요하며, 호환성이 좋아야한다.

(2) 장단점

Notebook 종류	장점	단점
Bound/stitched	분실된 페이지가 없으면 법적으로 강력한 효력을 발생시킨다.	논리적으로 구성되지 않고 복사하기 어려우므로 다른 곳에 저장된 데이터에 대한 참조가 필요함
Loose Leaf/Binder	실험에 의해 구성되고, 데이터가 함께 저장됨	시트가 빠져서 인증이 어렵다.
Computer/Electronic	검색하기 쉽고, 읽기 쉽고, 디지털 데이터를 저장하기 쉬움	전자 보안, 손상된 파일, 소프트웨어 호환성 문제 필요

 

3. Lab notebook에 들어가야 할 구성 요소들

1. 노트북 이름
2. 내부 표지 또는 표지
3. 작성자 이름, 년도
   프로젝트 진행하는 사람의 이름과 작성 시작 년도가 필요하다.
4. 일반 프로젝트명
5. Lab 메일 주소
   랩의 주소와 PI의 이름이 있어야한다. 
6. 목차
   • Page number
   • Date
   • Subject/Experiment
     예시)
     
7. 노트북 본문
8. 실험항목
   • 날짜
     
   • 제목
   • 가설 또는 목표: 목적의 간략한 진술
   • 배경
     실험의 이면에 있는 논리를 설명할 수 있어야한다.
     여기에는 마치 논문의 introduce와 같다고 생각하면된다.
     사고과정의 짦은 글, 이전 실험에 대한 언급, 이전에 발표된 프로토콜 참조(수행된 모든게 담겨져 있어야한다.)
     가 포함 될 수 있다.
   • 방법: 프로토콜, 계산, 시약, 장비
   • 관측치
     • 모든 일
       오류든 사고든 실수든 모든 프로토콜의 일을 기록할 필요가 있다.
     • Raw experimetal data
     • 참조한 정보에 대한 주소
   • 데이터 분석
     • Raw Data, 그래프, 해석 처리
       데이터가 분석되면 무엇이 중요해질지 알 수 없으므로 모든걸을 기록해야한다.
       또한, 인쇄하거나 별도의 종이에 쓰는 모든 데이터를 따로 백업해놔야한다.
       Notebook에 입력할 수 없는 경우 데이터가 저장된 위치에 대한 참조를 포함해야한다.
   • 향후 실험에 대한 아이디어

 

반드시 데이터가 아무리 나쁘거나 실수로 인해 이상하더라도, 정직하게 쓰는것이 항상 최선임을 기억하라.

 

마침글

느낀바가 많다. 연구는 단순히 나 잘되라고 하는것이 아니라, 내 지식을 이어서 받아가야 할 사람이 필요하고

그 사람이 남긴것으로 또 이어가야하는것이다. 

 

앞으로는 Git 혹은 Blog를 통해서 Project 관리를 하는것이 좋다고 느꼈으며,

Jornal도 필요하다고 느꼈다. 예를 들어, ~에 대해 모른다면, 적어야할 것 아닌가?